Hallo,
um welchen CPU-Kühler/Lüfter geht es?
Grundsätzlich kann man auch einen CPU Lüfter an einem Anschluss für Gehäuselüfter betreiben, nur sollte man an ein Mainboard haben, bei dem man diesen Lüfteranschluss nach der CPU-Temperatur regeln kann (im BIOS), andernfalls besteht die Gefahr, dass die CPU nicht richtig gekühlt wird.
Ein Verlängerungskabel ist daher die bessere Wahl, aber hängt wie gesagt vom Kabel-/Steckertyp ab, welches passt. Daher die Frage nach dem Kühler.
LG N.